島津液相色譜柱是色譜分析系統的“心臟”。由于待分析樣品種類繁多，樣品基質復雜，色譜柱極易被強保留物質污染。這些強烈保留的物質通常很難洗脫。多次加載后，它們聚集在柱頭端，堵塞篩板，甚至與填料相互作用，導致填料變性，導致柱效率下降，分辨率降低，峰型異常。島津液相色譜柱的物理性質有著5點參數：
1、柱長，內徑，如250*4.6mm。一般柱長在2—250mm，柱越長，分離度越高，但柱壓更高，分離所需時間更長；但分離度與理論塔板數的平方根成正比，所以一昧增加柱長并不是*的分離手段，一般情況下，150mm、5um的填料可以提供足夠的塔板數。
2、粒徑，影響色譜分離度。粒徑越小，分離越快，柱效越高，但柱壓力越高，柱容易被污染，導致柱壽命降低。常見分析柱通常使用5um填料，復雜的多組分樣品分離一般使用3.5um粒徑，更大內徑的制備色譜柱通常使用更大的粒徑。如果固定相選擇是正確，但是分離度不夠，那么選用更小的粒度的填料是很有用的。3.5um填料填充柱的柱效比相同條件下的5um填料的柱效提高近30%；然而，3.5um的色譜柱的背壓卻是5um的2倍，因此如何選擇填料粒徑需要根據現實情況而定。
3、孔徑，60A，120A，300A等。孔徑小，則含孔率高，比表面積大，載碳量高；色譜柱填料孔徑大小需和分子大小相匹配，保證分子自由進出填料孔并與孔內表面的鍵合相進行分離分配，通常要求孔徑直徑是分子直徑的3倍以上，一般小分子使用80—120A，大分子使用300A。
4、顆粒形狀，一般有球形和不規則形，當使用黏度較大的流動相時，球形顆粒可以降低柱壓，延長色譜柱壽命。
5、比表面積，指的是每克填料的表面積，如180m2/g—350m2/g，與粒度和含孔率有關；比表面積大，會增加樣品與鍵合相之間的反應，增加保留和分離度；比表面積小則可以縮短分析時間和平衡時間，并不是比表面積大或者小就更好，需要選擇合適的比表面積。
